また、戦争当時、錦町で人吉海軍航空基地の設営に携わった人や、軍人秘書をしていた女性、2度の空襲を経験した由留木集落の方など、当時を知る人の証言ビデオが用意されており、戦争体験者の生の声を知ることができます。

人吉海軍航空基地は、1943（昭和18）年に基地建設が始まりました。長さ1,500メートル、幅50メートルのコンクリート滑走路を備えた本格的な飛行場で、翌年からはパイロットやエンジニアを育成する教育基地として使われ、約6,000人もの予科練生たちがこの地で学びました。
その後、激化する戦局を反映するかのように、空襲を受けても戦闘や生産を継続できるように、地下に数多くの軍事施設が掘り進められました。この地下軍事施設のうち、「魚雷調整場」や、「地下作戦室・無線室」「地下兵舎壕」などは、現在「ひみつ基地ミュージアム」のガイドツアーで回ることができます。
地下軍事施設の全容は地元の人にも知らされておらず、まさに“ひみつ基地"だったことともあり、長い間単なる防空壕だと思われていました。しかし、2015年に地元の有志による調査・研究によって、実はさまざまな軍事目的を持った地下施設であったことが明らかになり、その後調査・研究・整備が進められました。終戦後70年もの時を経て歴史の謎が明らかになったのです。そして錦町から隣の相良村にかけて、50以上の地下軍事施設が現存しています。

「ひみつ基地ミュージアム」でぜひ体験していただきたいのが、地下軍事施設を回るガイドツアーです。ツアーでは「魚雷調整場」「地下兵舎壕」「地下作戦室・無線室」など、現存する地下軍事施設の遺構に入って見学ができます。
いずれの地下施設も、当時の設備等が残っているわけではないため、一見するとどれも真っ暗で大きな洞窟ですが、ガイドさんの案内で歴史的背景や、施設の使われ方を聞きながら回ることで、当時の様子を臨場感たっぷりに思い浮かべることができるのです。
「魚雷調整場ガイドツアー」は入館料800円の中に含まれているので、ぜひ逃さず体験してください。所要時間は40分ほど。ガイドさんと一緒にミュージアムを出て、魚雷調整場まで坂を下りて移動します。歩きやすく、汚れてもいい靴で訪れてください。

地下魚雷調整場は縦横に入り組んだ構造をしており、これは万が一魚雷が誤爆した時に近くが延爆しないように、設計されているとのこと。

真っ暗な上に、夏は暑く冬は寒い地下施設。この過酷な環境で、誤爆の可能性もある魚雷調整という繊細な作業をしていたことに驚きを覚えます。

「地下兵舎壕」「地下作戦室・無線室」はオプションガイドで、500円（小学生400円、未就学児200円）で参加できます。事前予約も可能ですので、興味のある方はあらかじめ申し込んでおきましょう。

ガイドさんによると、戦争中「地下兵舎壕」には二段ベッドが置かれ、多くの予科練生たちが寝起きしていたそうです。直線で約80メートルの暗い横穴を奥に進みながら、ここで暮らしていた10代の少年たちに思いを馳せることで、過酷な暮らしを肌で感じ、改めて戦争、平和について考えるきっかけになるかもしれません。

2021年3月1日には新館がグランドオープンしました。新館には当時の予科練生が整備や飛行の練習に使っていた「九三型中間練習機（通称赤とんぼ）」の実物大模型が展示されています。

一日かけてじっくり見て過ごしたいミュージアムです。「ひみつ基地」の名前に心惹かれた子ども連れの家族も多いのだとか。ミュージアム内は木造建築の温かみを感じられ、誰もが気軽に訪問しやすい雰囲気です。こういったミュージアムを身近に感じ、気軽に訪問することが、歴史を知る第一歩かもしれません。